Meiner Meinung nach ist das was du vorhast so nicht realisierbar. Was du anstatt dessen machen könntest wäre:
Die Seite auf der deine 2 iFrames sind, ist wahrscheinlich die Datei index.htm. Diese kopierst du einmal, nennst die Kopie index2.htm und bastelst dir in dieser Datei aus deinen 2 iFrames eins. Alle Seiten, auf denen du jetzt dieses eine große iFrame benötigst verlinkst du dann auf diese index2.htm. target="_top" darfst du dannj natürlich nicht vergessen.
Das Menü der index2.htm muss dann natürlich auch noch angepasst werden.
Oder mach am besten gleich für jede Seite eine neue Datei und werf die iFrames über den Haufen...